MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 17322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013716	GCA	3	9	39	47	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013716	TAA	2	6	69	74	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013716	AC	3	6	122	127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013716	CAGA	2	8	132	139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013716	ACA	2	6	157	162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013716	A	6	6	250	255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013716	T	8	8	279	286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013716	AAC	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013716	GCGCT	2	10	5016	5025	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_013716	GCC	2	6	5069	5074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_013716	ATG	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013716	GCC	2	6	5124	5129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_013716	A	6	6	5957	5962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013716	TTG	2	6	7432	7437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013716	TA	3	6	7489	7494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013716	CGT	2	6	7624	7629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013716	ATC	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013716	AC	3	6	7681	7686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013716	CTGT	2	8	8695	8702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013716	CCTT	2	8	8703	8710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013716	AAT	2	6	8751	8756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013716	GCG	2	6	9368	9373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013716	GT	3	6	9383	9388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013716	ATT	2	6	9392	9397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013716	C	6	6	10781	10786	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_013716	G	6	6	10791	10796	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013716	AAG	2	6	10800	10805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013716	ATC	2	6	11388	11393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013716	ATTG	2	8	11394	11401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013716	A	6	6	11422	11427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013716	GTT	2	6	11430	11435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013716	ATA	2	6	11451	11456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013716	TCA	2	6	11485	11490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013716	ATG	2	6	11497	11502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013716	GC	3	6	11537	11542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013716	ATTT	2	8	11543	11550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013716	T	6	6	11566	11571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013716	C	6	6	11577	11582	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_013716	TGA	2	6	11584	11589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013716	TAG	2	6	11609	11614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013716	TGA	2	6	11625	11630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013716	A	8	8	11636	11643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013716	ATG	2	6	11699	11704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013716	GTAA	2	8	13663	13670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013716	TC	3	6	13689	13694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013716	ACA	2	6	13728	13733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013716	T	7	7	14901	14907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013716	TCAT	2	8	14913	14920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013716	ATAA	2	8	14948	14955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013716	TGA	2	6	14964	14969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013716	TTTA	2	8	14972	14979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013716	TTG	2	6	15101	15106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013716	AAT	3	9	15107	15115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013716	T	7	7	15131	15137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013716	CTT	2	6	15145	15150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013716	TAA	2	6	16120	16125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013716	AAT	2	6	16618	16623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013716	ATA	2	6	17209	17214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013716	TGA	2	6	17654	17659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013716	ATTA	2	8	17682	17689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013716	ATAAA	2	10	17708	17717	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013716	CT	3	6	17727	17732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013716	TAAA	2	8	17778	17785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013716	ATT	2	6	17832	17837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013716	TGAA	2	8	17848	17855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013716	AT	3	6	17864	17869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013716	ATC	2	6	17914	17919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013716	T	6	6	17923	17928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013716	T	6	6	17948	17953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013716	ATT	2	6	17966	17971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013716	GAAC	2	8	17981	17988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013716	CAG	2	6	20121	20126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013716	TTA	2	6	20187	20192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013716	AGAC	2	8	20206	20213	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013716	TTG	2	6	20278	20283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013716	GTAC	2	8	20365	20372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013716	CATC	2	8	20434	20441	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013716	T	9	9	20587	20595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013716	TCA	2	6	20617	20622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013716	AAT	2	6	20625	20630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013716	AG	3	6	20689	20694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013716	G	6	6	21883	21888	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013716	GC	3	6	22831	22836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013716	GC	3	6	22845	22850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013716	TCC	2	6	24906	24911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013716	TAT	2	6	26326	26331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013716	TTTC	2	8	26374	26381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013716	AT	3	6	26386	26391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013716	TGA	2	6	26392	26397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013716	TAG	2	6	26423	26428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013716	TGA	2	6	26441	26446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013716	AATT	2	8	26508	26515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013716	A	7	7	26692	26698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013716	CAAC	2	8	26728	26735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013716	CTT	2	6	27069	27074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013716	AGCGC	2	10	31654	31663	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013716	GGC	2	6	31688	31693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013716	AGCGC	2	10	31739	31748	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_013716	GGC	2	6	31773	31778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013716	GTG	2	6	31849	31854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013716	AGCGC	2	10	31912	31921	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_013716	GGC	2	6	31946	31951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013716	AGCGC	2	10	31997	32006	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_013716	GGC	2	6	32031	32036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013716	AGCGC	2	10	32082	32091	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_013716	TCAT	2	8	33544	33551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013716	T	6	6	33580	33585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013716	TGT	2	6	33632	33637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013716	CCTT	2	8	33665	33672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013716	AGCC	2	8	33675	33682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013716	CTG	2	6	33723	33728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013716	GCT	2	6	33732	33737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013716	CCG	2	6	33747	33752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013716	GA	3	6	33761	33766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013716	TAT	2	6	34584	34589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013716	GAA	2	6	34594	34599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013716	GCA	2	6	39095	39100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013716	GGA	2	6	39102	39107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013716	CAT	2	6	40120	40125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013716	GCCT	2	8	40141	40148	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013716	GGC	2	6	40186	40191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013716	TTTTA	2	10	41147	41156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013716	AAATT	2	10	41192	41201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013716	T	7	7	41253	41259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013716	GC	4	8	41289	41296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013716	AGTT	2	8	41314	41321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013716	CGTTC	2	10	41346	41355	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_013716	A	6	6	41375	41380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013716	GCC	2	6	41423	41428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_013716	AGTG	2	8	41499	41506	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013716	ATT	2	6	45928	45933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013716	T	7	7	45967	45973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013716	CTGG	2	8	45987	45994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013716	CGC	2	6	46002	46007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013716	CAAG	2	8	46030	46037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013716	GGC	2	6	46576	46581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013716	TCA	2	6	46650	46655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013716	GGC	2	6	46675	46680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013716	G	6	6	46703	46708	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013716	AGCGC	2	10	46740	46749	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_013716	GGC	2	6	46774	46779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013716	CCG	2	6	47607	47612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_013716	T	7	7	50463	50469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013716	AGCGC	2	10	50480	50489	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_013716	GGC	2	6	50510	50515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013716	AAAAT	2	10	53261	53270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013716	TAT	2	6	53306	53311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013716	T	6	6	53318	53323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013716	AGT	2	6	53537	53542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_013716	CAGG	2	8	55432	55439	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013716	ACA	2	6	57060	57065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013716	T	6	6	57110	57115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013716	T	6	6	57170	57175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_013716	CGG	2	6	58252	58257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_013716	T	7	7	80610	80616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_013716	TAA	2	6	80641	80646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_013716	TAA	2	6	124092	124097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_013716	CGCTT	2	10	126870	126879	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
283	NC_013716	T	6	6	126927	126932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_013716	GGC	2	6	127417	127422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_013716	ATA	2	6	129037	129042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_013716	A	7	7	129132	129138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_013716	TGT	2	6	130294	130299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_013716	TCA	2	6	133486	133491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_013716	GGC	2	6	133511	133516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_013716	GTCAGC	2	12	133548	133559	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_013716	GCGCT	2	10	136051	136060	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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430	NC_013716	AAT	2	6	200341	200346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_013716	A	7	7	200382	200388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_013716	TAAA	2	8	201263	201270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_013716	GCG	2	6	203976	203981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_013716	A	6	6	204049	204054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_013716	CGT	2	6	204867	204872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_013716	AAT	2	6	204883	204888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_013716	T	6	6	204986	204991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_013716	A	6	6	205031	205036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_013716	GTTCA	2	10	205068	205077	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
440	NC_013716	CAA	2	6	205089	205094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_013716	GC	3	6	205128	205133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
442	NC_013716	AC	4	8	205200	205207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
443	NC_013716	TA	3	6	205280	205285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_013716	GTA	2	6	206056	206061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_013716	CTT	2	6	207039	207044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_013716	TTG	2	6	207138	207143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_013716	GAAA	2	8	207154	207161	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
449	NC_013716	ACTT	2	8	207935	207942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
450	NC_013716	GCC	2	6	208026	208031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
451	NC_013716	GTCTG	2	10	208150	208159	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
452	NC_013716	CGC	2	6	208766	208771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
453	NC_013716	TCC	2	6	208780	208785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
454	NC_013716	GGC	2	6	208795	208800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_013716	T	6	6	208808	208813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_013716	T	6	6	210138	210143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_013716	T	6	6	210173	210178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_013716	ATA	2	6	213254	213259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_013716	TTC	2	6	215696	215701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_013716	CA	3	6	217343	217348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
464	NC_013716	TTA	2	6	217393	217398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_013716	CAT	2	6	224908	224913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_013716	T	6	6	224945	224950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_013716	A	7	7	224958	224964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_013716	GGC	2	6	225312	225317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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477	NC_013716	TCC	2	6	225437	225442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
478	NC_013716	CGG	2	6	228148	228153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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480	NC_013716	CGG	2	6	228242	228247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
481	NC_013716	GGC	2	6	228330	228335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_013716	TAAAGA	2	12	228389	228400	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_013716	TGC	2	6	228595	228600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
490	NC_013716	CGG	2	6	228689	228694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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